Seit einiger Zeit werden immer wieder Zufluchtsorte der Mutanten von Genom X-Agenten entdeckt und verwüstet. Als sich Adam und Emma die Überwachungsvideos ansehen, erkennt Emma darauf ihre alte Freundin Michelle wieder. Bei einem Treffen der beiden stellt sich allerdings heraus, dass Michelle für Eckhart arbeitet. Sie kann ihr Gehirn direkt mit Computern vernetzen und hat Eckhart so dabei geholfen, die Verstecke der neuen Mutanten aufzuspüren. Emma möchte Michelle in Eigenregie auf die richtige Seite zurückbringen. Doch als ihr Plan fehlschlägt, bringt sie sich und ihre Freunde in höchste Gefahr.