Gebaseerd op Lloyd Kaufmans cultkomedie uit 1984, vertelt The Toxic Avenger The Musical het verhaal van de inwoners van Tromaville die schreeuwen om een held. Maak kennis met de nerdy Melvin Ferd the Third, een aspirant-aardwetenschapper, vastbesloten om het grootste giftig afvalprobleem van de staat op te lossen. Wanneer een corrupte burgemeester en haar regeringsmannen lucht krijgen van zijn plannen, beloven ze deze heroïsche prestatie te stoppen. Melvin wordt aangevallen en in een vat met giftig afval gegooid... waardoor hij onmiddellijk verandert in The Toxic Avenger, de eerste superheld van New Jersey! Toxie is een 2 meter lange mutant freak met bovenmenselijke kracht en een bijpassend supergroot hart. Zijn doel is om het zwaar vervuilde New Jersey te redden, de opwarming van de aarde te beëindigen, het hart van de mooiste (blindste) bibliothecaris van de stad te winnen - en op tijd thuis te komen voor het eten!