Kira e Bashir stanno tornando da una missione, ma quando arrivano all'uscita del tunnel spaziale scoprono di trovarsi in un universo parallelo, dove il pianeta Bajor è alleato con i Cardassiani e con l'Impero Klingon. Gli uomini del disciolto Impero Terrestre sono costretti a lavorare come schiavi e una Kira Nerys ambiziosa e crudele comanda la base spaziale. Sembra che tutto questo sia dovuto all'interferenza avvenuta anni prima da parte di un certo Capitano James Kirk...