La saga continue... New Caprica est envahie par les Cylons. Le nouveau président, Gaïus Baltar, est contraint de se rendre et de mettre en place une politique de collaboration avec l'ennemi - La population décide de réagir en formant un groupe de résistance pour attaquer les Cylons. Pendant ce temps, le Galactica, toujours en orbite, s'interroge sur la meilleure façon de venir en aide à ses semblable.