Phineas y Ferb visitan el Museo de Danville y ven una Máquina del Tiempo sin acabar y deciden terminarla y hacer que funcione y como siempre Candace se chivará a su madre, pero por eso, accidentalmenet viaja con Phineas y Ferb a la Prehistoria y un dinosaurio sin querer rompe la máquina y no pueden volver, mientras Doofenshmirtz lucha contra otro enemigo, Peter el panda, y Perry el ornitorrinco se lo toma fatal dejando su trabajo como agente secreto, ¿volverá a las andadas?