En Prodigio se cuentan dos historias paralelas. Consuelo y Nicolás viven alienados en su soledad. Se conocen un dia por casualidad y se sienten atraídos. Pasan juntos ese día en la casa de Nicolás, conociéndose y sintiendo una conexión cada vez más fuerte. Nicolás y Consuelo se encuentran algunos años mas tarde, después de haber vivido juntos y de haberse separado hace unos meses. Nicolás va a buscar algunas cosas que quedaron en la casa que compartieron con Consuelo y viven quizá el ultimo encuentro en sus vidas. Estos dos momentos se narran en forma alternada, yendo y viniendo entre pasado y presente, de forma de construir una continuidad.