Jack Carter (Colin Ferguson) und seine Freunde sind wieder zurück von ihrer Zeitreise. Allerdings ist in der Gegenwart nicht mehr alles so, wie es vorher war. Trotz diverser Herausforderungen versuchen die Zeitgereisten sich in der Parallelgegenwart zurechtzufinden. Denn auch im ‚neuen‘ Eureka haben sie mit großen Problemen zu kämpfen. Henry (Joe Morton) sucht fieberhaft nach einem Weg, wie sie wieder in die richtige Realität gelangen können. Doch was, wenn dies nicht gelingt?